El maligno Shao Khan quiere gobernar la Tierra. Para que él pueda llegar a nuestra tierra, sus guerreros deben ganar el torneo de Mortal Kombat 10 veces en línea. Para el tiempo en el que se desarrollo el primer juego, ya habían ganado el torneo nueve veces. Tú los detuviste... pero sólo si descargaste el juego y ganaste.

Debes elegir al luchador que quieras ser y darle una muy buena paliza a cualquiera que se interponga en tu camino. Como un bonus, puedes matar a tus enemigos de dos formas diferentes después de que los hayas derrotado (2 fatalities).